Состав и структура органов, осуществляющих бюджетный контроль, определяют­ся государственным устройством страны, а также функциями и задачами, решаемыми государством на определенном этапе своего развития. Разработка и осуществление новой бюджетно-налоговой и финансовой политики направлены на усиление воздейст­вия финансовых рычагов на социально-экономические процессы в обществе. Здесь остро встал вопрос о создании соответст­вующих финансовых институтов рыночного типа, способных эф­фективно претворить в жизнь намеченную политику.

Президентский контроль соблюдения бюджетно-налоговой дисциплины служит важным элементом госу­дарственного управления, проведения единой фискальной поли­тики на всей территории страны и сохранения ее целостности. Он осуществляется в соответствии с Конституцией РФ путем изда­ния указов по финансовым, бюджетным и налоговым вопросам, подписания федеральных законов и пр.

Функции финансового контроля также выполняет Главное Контрольное управление Президента РФ (ГКУ РФ), действующее на основе Указа Президента РФ № 383 от 16.03.96 г. Оно является структур­ным подразделением Администрации Президента и подчиняется непосредственно Президенту, но также взаимодействует со всеми орга­нами исполнительной власти. Среди функций ГКУ РФ — контроль деятельности органов контроля и надзора при федеральных ор­ганах исполнительной власти, подразделений Администрации Президента, органов исполнительной власти субъектов Федера­ции; рассмотрение жалоб и обращений граждан и юридических лиц.

ГКУ РФ имеет право требовать от руко­водителей государственных органов, организаций и предприятий (независимо от формы собственности) предоставления докумен­тов, материалов и информации, необходимой для прове­дения проверок; привлекать к проверкам специалистов и предста­вителей правоохранительных органов и вносить на рассмотрение Президента предложения по результатам проверок. Оно вправе на­правлять предписания об устранении финансовых нарушений, ко­торые должны быть рассмотрены должност­ными лицами в течение 10 дней. Применять же какие-либо санкции  самостоятельно ГКУ не вправе.