Рассматриваемый фонд был учтен в составе расходов федерального бюджета на 1998 г. в сумме 3 222 тыс. рублей. Источником образования фонда служат отчисления на воспроизводство минерально-сырьевой базы в части, зачисляемой в доход федерального бюджета. Указанные отчисления взимаются с пользователей недр, осуществляющих добычу всех видов полезных ископаемых, разведанных за счет государственных средств.
Ставки отчислений на воспроизводство минерально-сырьевой базы устанавливаются федеральным законом в виде процентной доли от стоимости фактически добытых полезных ископаемых. Действующие в современном периоде процентные ставки отчислений определены Федеральным законом № 224-ФЗ от 30.12.1995 г. и составляют, к примеру, по нефти и газу 10 %, по углю –5 %, по торфу – 3 %, по железным и хромовым рудам — 3,7 %, по цветным и редким металлам — 8,2 %.
Отчисления на воспроизводство минерально-сырьевой базы зачисляются в федеральный бюджет и в бюджеты субъектов РФ. Распределение фондов между этими видами бюджетов осуществляется исходя из федеральной и территориальных государственных программ геологического изучения недр и воспроизводства минерально-сырьевой базы. В 1998 г. за счет указанного источника предусматривалось формирование территориальных фондов воспроизводства минерально-сырьевой базы.
В федеральном бюджете на 1998 г. были установлены следующие направления использования средств фонда: на геологическое изучение недр РФ, континентального шельфа и Мирового океана; на затраты по управлению Государственным фондом недр, на геолого-разведочные работы.