Контроль – непрерывный процесс. Контроль позволяет осуществлять проверки и сопоставления фактических результатов с заданными по оптимизации природопользования с соблюдением экологической безопасности. Данная функция управления обусловливает необходимость введения экологического аудита и мониторинга природопользования.

Экоменеджер обеспечивает обратную связь, собирает информацию о текущем состоянии исполнения внутри фирмы. Почти все, что думает управляющий, обращено в будущее через планы и стратегию. Если контроль задуман как слежение (мониторинг) или регулирование плана, то цель, на которую направлены планирующие усилия, должны быть установлены заранее.

Нормы контроля устанавливаются раньше, чем в них появляется необходимость. Нормы могут быть: статистическими (на основе прошлых наблюдений); нормами здравого смысла (на основе оценки специалиста); техническими (базирующимися на объективном количественном  анализе специфических ситуаций с помощью наблюдений за выполняемым процессом).

Контроль может быть чрезмерным и ограничивающим. Результатом чрезмерного контроля могут быть более высокие издержки, чем приносимые выгоды. Ограничивающий же контроль может подавлять инициативу, вызывать возмущение и, в конце концов, привести к отрицательному результату.