Для выполнения возложенных на них функций таможенные органы наделены следующими правомочиями:

1) принимать предусмотренные Таможенным ко­дексом РФ меры в целях обеспечения соблюдения та­енного законодательства Российской Федерации;

2) требовать документы, сведения, представление которых предусмотрено в соответствии с положением Таможенного кодекса РФ;

3) проверять у граждан и должностных лиц, участвующих в таможенных операциях, документы, удостоверяющие их личность;

4) требовать от физических и юридических лиц подтверждения полномочий на совершение определенных действий или осуществление определенной деятельности в области таможенного дела;

5) осуществлять в соответствии с законодательством Российской Федерации оперативно-розыскную дельность в целях выявления, предупреждения, пресечения и раскрытия преступлений, производство неотложных следственных действий и дознание по которым отнесено уголовно-процессуальным законо­дательством Российской Федерации к ведению тамо­женных органов, а также в целях выявления и установления лиц, их подготавливающих, совершающих или совершивших, а также обеспечения собственной безопасности;

6) осуществлять неотложные следственные дей­ствия и дознание в пределах своей компетенции и в порядке, которые определены уголовно-процессуаль­ным законодательством Российской Федерации;

7) осуществлять производство по делам об адми­нистративных правонарушениях и привлекать лиц к ответственности за совершение административных правонарушений в соответствии с законодательством Российской Федерации об административных пра­вонарушениях;

8) использовать в случаях, не терпящих отлага­тельства, средства связи или транспортные средства, принадлежащие организациям или общественным объединениям (за исключением средств связи и транс­портных средств дипломатических представительств, консульских и иных учреждений иностранных госу­дарств, а также международных организаций), для предотвращения преступлений в сфере таможенного дела, преследования и задержания лиц, совершивших такие преступления или подозреваемых в их совер­шении. Имущественный вред, понесенный в таких случаях владельцами средств связи или транспорт­ных средств, таможенные органы возмещают по тре­бованию владельцев средств связи или транспортных средств в порядке, определяемом Правительством РФ;

9) задерживать и доставлять в служебные поме­щения таможенного органа или в органы внутрен­них дел лиц, подозреваемых в совершении преступ­лений, совершивших или совершающих преступления или административные правонарушения в области таможенного дела, в соответствии с законодательством Российской Федерации;

10) производить документирование, видео- и аудиозапись, кино- и фотосъемку фактов и событий, связанных с перемещением товаров и транспортных средств через таможенную границу и осуществлением перевозки, хранения находящихся под таможенным контролем товаров, а также с совершением грузовых операций;

11) получать от государственных органов, организаций и физических лиц информацию, необходимую для выполнения своих функций;

12) выносить руководителям государственных органов, организаций, предприятий, общественных объединений, а также гражданам предупреждения в письменной форме с требованиями устранить нарушения таможенного законодательства Российской Федерации контролировать выполнение указанных требований;

13) предъявлять в суды или арбитражные суды исковые заявления: о принудительном взыскании таможенных пошлин, налогов; об обращении взыскания на товары в счет уплаты таможенных пошлин, налогов; в иных предусмотренных Таможенным кодексом РФ и другими федеральными законами случаях;

14) устанавливать и поддерживать официальные отношения консультативного характера с участниками внешнеэкономической деятельности, иными лицами, деятельность которых связана с осуществлением внешнеэкономической деятельности, и их профессиональными объединениями (ассоциациями) в целях сотрудничества и взаимодействия по вопросам внедрения наиболее эффективных методов осуществления таможенного оформления и таможенного контроля;

15) осуществлять иные правомочия, предусмот­ренные Таможенным кодексом РФ и иными феде­ральными законами.

В рамках последнего пункта, в частности, поло­жениями ст. 409 и 410 ТМК РФ закреплены права таможенных органов при осуществлении таможен­ного контроля с использованием судов таможенных органов и права таможенных органов в отношении автотранспортных средств, перевозящих товары, на­ходящиеся под таможенным контролем.