Первая школа в крае была открыта в 1875 году в г. Хабаровске. По переписи 1923 г. грамотных в крае насчитывалось менее 40 % от взрослого населения, а среди малочисленных народов – только 2 %. В 30-е г. неграмотность была ликвидирована полностью. По переписи 1989 г. на 1000 человек в крае приходилось 127 с высшим образованием, с незаконченным высшим и средним – 501, с неполным средним – 237. В 1992 – 1993 учебных годах в крае имелось 500 общеобразовательных школ. Открыты первый в России психосоматический центр охраны здоровья детей и подростков, 2 центра реабилитации слуха и речи. В крае 45 ПТУ, в которых идет обучение 400 профессиям и специальностям. Действует 39 средних специальных учреждений. В частности, 6 колледжей: машиностроительный, связи и информации, технологический, педагогический, Восточный коммерческий гуманитарный, искусств, 18 техникумов и 5 училищ. В 13 вузах края обучается  около 40 тыс. студентов. В основном вузы сосредоточены в Хабаровске: технический университет, Дальневосточный государственный университет путей сообщения, военный институт пограничных войск, медицинский, народного хозяйства, педагогический, физической культуры, искусств и культуры, фармацевтический институты, дальневосточный кадровый центр, Высшая школа милиции МВД. В Комсомольске-на-Амуре – технический и педагогический университеты. В крае действуют около 30 научных учреждений (институты, филиалы, лаборатории, опытные станции, архивы и др.). Дальневосточное отделение Российской академии наук (ДВО РАН) представлено институтами водных и экологических проблем, тектоники и геодезии, экономических исследований, горного дела, материаловедения, вычислительным центром, Хабаровским отделением института прикладной математики. В Хабаровске также размещены дальневосточное отделение Российской академии сельскохозяйственных наук, институт охраны материнства и детства Академии медицинских наук России.