К предметным относятся программы, выполняющие непосредственно моделирование состояний и процессов в объектах проектирования. Примерами предметных программ САПР могут служить программы составления математических моделей РЭУ, расчета переходных процессов, расчета частотных характеристик, логического моделирования и т.д. Разработка этих программ занимает основную часть времени при создании САПР, а их функционирование – основную часть машинного времени работы САПР. Качество САПР определяется качеством предметных программ.