Последовательность проведения ФСА включает следующие этапы:

· подготовительный;

· информационный;

· аналитический;

· творческий;

· исследовательский;

· рекомендательный;

· внедрения.

На подготовительном этапе выбирают объект исследования, создают временную исследовательскую группу из специалистов разного направления для более полного охвата всех инженерно-экономических и технологических особенностей объекта. Разрабатывается подробный календарный план выполнения исследования, оформляются все нормативные документы, связанные с проведением ФСА (приказ руководителя о проведении анализа определенного объекта, о привлечении определенных работников к выполнению этой работы, о материальном поощрении работников по результатам анализа).

Главная задача информационного этапа – сбор, изучение и обобщение разнообразных данных об исследуемом объекте. Они должны отражать условия производства, реализации и потребления изделия, новейшие достижения в отраслях науки и техники, содержать всю технологическую и экономическую информацию, имеющую отношение к анализируемому объекту. Данный этап нередко называют фундаментом ФСА, потому что от полноты и достоверности собираемой информации во многом зависит успех последующих этапов ФСА.

На аналитическом этапе проводят детализацию изучаемого объекта на функции, проводят их классификацию, определяют стоимость каждой из них. Практически это означает создание функционально-стоимостной модели объекта. В результате проведенных исследований должны быть выявлены зоны наибольшей концентрации затрат, т.е. наиболее перспективные зоны с точки зрения задач ФСА. На основании этого формулируются задачи по усовершенствованию объекта с целью сокращения затрат на его производство, обосновываются направления дальнейшего исследования.

На творческом этапе разрабатывают варианты упрощения и удешевления конструкции изделия или технологии. Решают задачи по совмещению функций, возможности ликвидации ненужных функций, удешевления элементов конструкции, устанавливаются разные варианты выполнения основных функций, производятся обсуждение и отбор наиболее реальных по реализации вариантов. Для обоснования эффективности каждого предложения используются методы «мозгового штурма», синектический, морфологический, Дельфы.

Главная задача исследовательского этапа – это экспериментальная проверка выдвинутых предложений. Для решения этой задачи проводят все необходимые технические, технологические и экономические расчеты, проверяется соответствие нового варианта изделия условиям его использования потребителями. Если расчетов недостаточно, создаются исследуемые образцы объекта и проводится их испытание по приспособленности  к существующему производственному оборудованию, и к условиям доставки до потребителя и эксплуатации.

На рекомендательном этапе окончательно выбирается вариант изменений исследуемого объекта. Согласуются все вносимые в него изменения с потребителями и поставщиками. Разрабатываются планы-графики внедрения результатов анализа в производство. Необходимая документация производственного характера передается технологическим, экономическим и другим заинтересованным службам.

На этапе внедрения  должны быть решены все вопросы, связанные с организацией производства нового варианта анализируемого изделия. Подводятся итоги проведенной работы, определяется ее экономический эффект, оформляется отчет о результатах анализа, решаются вопросы материального поощрения участников разработки и внедрения результатов ФСА.

В зависимости от особенностей конкретного объекта, технологии его производства и других причин методика выполнения ФСА может существенно изменяться, но общие принципы методологии должны соблюдаться.