Организацию бюджетного процесса на территориях рассмотрим на примере Санкт-Петербурга. Организация бюджетного процесса в Санкт-Петербурге определяется на основе федерального бюджетного законодательства, а также в соответствии с Законом Санкт-Петербурга «Об основах бюджетного процесса в Санкт-Петербурге» от 05.01.96 г. № 155-26. Например, работа над проектом бюджета Санкт-Петербурга на 1998 г. была начата в феврале 1997 г. В июне в Законодательное собрание города был представлен финансовый план-прогноз развития Санкт-Петербурга до 2001 г. и основные показатели бюджета города на 1998 г.
Отличительная черта бюджета на 1998 г. — более современная процедура составления его проекта. Так, отраслевым органам и территориальным управлениям Администрации Санкт-Петербурга было предоставлено право самостоятельного определения направления расходования бюджетных средств на основе контрольных цифр (предельных объемов финансирования) и перечня целевых статей.
Контрольные цифры были определены Комитетом финансов и доведены до каждого комитета и территориального управления. Основными распорядителями бюджетных средств в 1998 г. стали отраслевые и территориальные органы власти Санкт-Петербурга. Остальные учреждения, получающие бюджетные средства, включаются в состав расходов отраслевого или территориального органа управления самостоятельной целевой статьей со своими экономическими элементами, что позволяет создать более эффективную ведомственную структуру расходов бюджета и строже спрашивать за его исполнение с ограниченного круга органов государственного управления.