Основная за­дача казначейства — организация и осуществление контроля  исполнения федерального (республиканского) бюджета РФ и федеральных внебюджетных фондов. На казначейство возложена функция перераспределения поступивших налогов между бюдже­тами разных уровней в соответствии с установленными законода­тельством нормативами — процентными отчислениями. Казначейство также осуществляет сбор, обработку и анализ информации о состоянии государственных финансов, представляет отчетные данные в высшие органы го­сударственной власти и управления о финансовых операциях Пра­вительства РФ по федеральному бюджету РФ, о федеральных вне­бюджетных фондах, о состоянии бюджетной системы РФ. Совместно с ЦБ РФ и другими банками оно управляет и обслуживает государственный внутрен­ний и внешний долг РФ; управляет доходами и расходами феде­рального бюджета и внебюджетных фондов на счетах казначейст­ва в банках, исходя из принципа единства кассы.

Казначейские органы прогнозируют объемы государственных финансовых ресурсов; разрабатывают ме­тодологические и инструктивные материалы по вопросам, отно­сящимся к компетенции казначейства; ведут операции по учету государственной казны.

Как контрольный орган, в целях укрепления бюджетно-налоговой дисциплины казначейство наделено следующими правами:

· производить в министерствах, ведомствах, на предприяти­ях и в организациях, банках и иных финансово-кредитных учреждениях любых форм собственности, включая со­вместные предприятия, проверки денежных документов, регист­ров бухгалтерского учета, отчетов, планов, смет и иных докумен­тов, связанных с зачислением, перечислением и использованием средств республиканского (федерального) бюджета РФ;

· получать от финансово-кредитных и налоговых органов справки и сведения о состоянии счетов предприятий и учрежде­ний, использующих средства федерального бюджета и федераль­ных внебюджетных фондов, необходимые для контроля и регули­рования бюджетных процессов;

· приостанавливать операции по счетам предприятий и организаций, использующих эти средства в случаях непредставления ор­ганам казначейства бухгалтерских и финансовых документов, связанных с использованием указанных средств;

· налагать на банки и иные кредитные учреждения штрафные санкции при несвоевременном зачислении ими средств, поступивших в доход федерального бюджета и внебюд­жетных фондов, или при переводе средств из этих фондов получателям;

· взыскивать в бесспорном порядке бюджетные и внебюджет­ные средства, полученные предприятиями и ор­ганизациями, в случае использования их не по целевому назначе­нию, с наложением штрафа в размере действующей учетной ставки ЦБ РФ;

· изымать на основе постановления должност­ного лица органа казначейства документы, свидетельствующие о нарушениях бюджетно-налоговой дисциплины;

· требовать от руководителей и других должностных лиц про­веряемых органов устранение выявленных нарушений и недостат­ков в порядке исполнения бюджета.

Для усиления контроля исполнения доходной части бюд­жета в РФ созданы и функционируют госу­дарственные органы налогового контроля. С введением в Российской Федерации новой налоговой систе­мы и приданием налогам важной роли в регулировании социаль­но-экономических процессов и формировании доходной базы бюджетов разных уровней остро встал вопрос об организации спе­циального аппарата управления и контроля за налогами. В резуль­тате были созданы налоговые органы РФ, к которым относятся Министерство РФ по налогам и сборам (МНС), Федеральные органы налоговой полиции (ФОНП) и ор­ганы Государственного таможенного комитета (ГТК).

По закону РСФСР «О Государственной налоговой службе РСФСР», принятому 21 марта 1991 г., правовое поло­жение Госналогслужбы определялось как обособленное подразде­ление, созданное на базе отдела государственных доходов при Министерстве финансов. Позже ГНС РФ был придан статус само­стоятельного органа, она была выведена из состава Минфина РФ и включена в систему центральных органов государственного управления РФ с подчинением Президенту и Правительству РФ. Это должно повысить роль, укрепить и обеспечить независимую деятельность ГНС и объективность контроль­ной работы.