Внедрение и эксплуатация САПР представляет не только сложную научно-техническую, но и организационную проблему, требующую создания специальных подразделений, ответственных за текущее состояние САПР, ее модификацию, правильное функционирование.
Совокупность правил, инструкций и документов, регламентирующих состав групп обслуживания САПР, их обязанности и взаимоотношения, образует организационное обеспечение САПР.
Методическое обеспечение САПР – это описания программ, баз данных, языков проектирования и различной инструкции по использованию всех видов обеспечения САПР.