В связи с развитием науки образовалась сложная иерархия узкоспециализированных дисциплин. В конце XIX – начале XX в. появилась жизненная необходимость в выполнении комплексных проектов. Появилась потребность в специалистах, которые занимались решением междисциплинарных наук. Появились новые науки: «Кибернетика», «Теория информации», «Исследование операций» и др. Начиная с 50-х годов ХХ в. стала формироваться общенаучная дисциплина «Общая теория систем» или «Системология». Системный анализ тесно связан с этими дисциплинами.
Общая теория систем занимается всевозможными вопросами исследования систем, а не только проблемами принятия решения, как это делается в системном анализе. В этом смысле системный анализ составляет существенную, важную в прикладном отношении часть теории систем.
Значительным достижением по теории систем выступают теория организации русского экономиста А.А. Богданова и общая теория систем американского биолога Л. Берталанфи (изобретатель модели человеческого мозга – персифтона). Истоки образования общей теории систем относят к 1954 г., когда группа из четырех ученых по моделированию в биологии, психологии и экономике образовали общество системных исследований. Делается немало попыток создания общей теории систем как метатеории. Достаточно сформировавшейся является математическая теория сложных систем (Р. Калман, М. Месарович, Н.П. Бусленко, Г.С. Поспелов, В.М. Глушков). В нашей стране эти работы особенно интенсивно стали выполняться после 60-х гг., когда был снят запрет на кибернетику.
Частью теории систем следует считать кибернетику, которая традиционно определяется как наука об управлении и преобразовании информации. Понятие управление близко, но не совпадает с принятием решения. Системный анализ перенял у кибернетики значительное количество терминов, такие как входы и выходы в системе, модули, потоки информации, структурные схемы.
Одним из наиболее сложных для обсуждения является термин «системотехника». Он определяется и как применение теории систем и системного анализа к области техники, и как применение техники, прежде всего вычислительной, при исследовании сложных систем. Еще более узко – как использование системного анализа для проектирования ЭВМ и сетей ЭВМ, а также создания их программного обеспечения (таково содержание квалификации «инженер-системотехник»).
Понятие информатика чаще всего понимается как исследование проблем хранения, использования и преобразования информации при помощи средств вычислительной техники. Информатика имеет технический, программный, математический и системный аспекты. Эта ветвь знания является одной из основ при проведении системного анализа при помощи ЭВМ.
Весьма близким к термину «системный анализ» является понятие исследования операций. В отечественной научной литературе исследование операций традиционно обозначает математическую дисциплину, занимающуюся исследованием математических моделей для выбора параметров, оптимизирующих некоторый критерий (или критерии) эффективности системы. Системный анализ может сводиться к решению ряда задач исследования операций, но обладает свойствами, не охватываемыми этой дисциплиной. Отметим, что в литературе США термин «исследование операций» не является чисто математическим и приближается к термину «системный анализ».
Укажем, что системный анализ взаимодействует со всеми перечисленными дисциплинами, а наиболее тесно связан с теорией систем. Системный анализ в значительной мере опирается на такие ее части, как структуризация, иерархия в системе, связь системы с «не системой» (внешней средой), законы протекания процессов в системе, эволюция системы, в том числе, самоорганизация. Специфические части самого системного анализа: целенаправленная система, выделение действий и приемы работы с ними, сочетание формализованных и неформализованных процедур, действия лица, принимающего решения, системные вопросы информатики. Широкая опора на исследование операций, которая имеет место, по крайней мере, в технике и экономике, приводит его к таким математическим разделам, как постановка задач принятия решения, описание множества альтернатив, методы и модели задач оптимизации, исследование многокритериальных задач и др.